Fondé en 1944 afin de contrer les expériences occultes menées par les nazis puis par les soviétiques, le B.P.R.D. - Bureau de Défense et de Recherches sur le Paranormal - intervient partout dans le monde où le besoin s'en fait sentir.
Hellboy fut l'un des premiers agents à l'intégrer avant de partir vivre des aventures en solo, dont l'issue s'est avérée dramatique...
Avec le retour de Liz Sherman au top de sa forme, ce n'est pas une, mais deux équipes du B.P.R.D. qui se lancent dans le feu de l'action ! Bien décidés à se frayer un chemin à travers les rues de Manhattan infestées de monstres, les membres du Bureau se ruent à l'assaut de la forteresse de la Flamme Noire...