Une nouvelle machine du nom d'Augma permet à ses utilisateurs d'expérimenter la Réalité Augmentée - une superposition d'éléments virtuels dans le monde réel... Cependant, d'anciens boss de SAO apparaissent au sein du jeu le plus utilisé de l'appareil, et les affronter semblent provoquer des pertes de mémoires chez les survivants du jeu de mort. Kirito commence alors son enquête pour tenter de faire retrouver ses souvenirs à Asuna.