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La bahía de Tumaco-Nariño ha sido considerada como uno de los sitios del Pacífico Colombiano con mayores problemas de contaminación por derrames de petróleo; se constituye así como un hábitat potencial para bacterias degradadoras de hidrocarburos. En esta investigación se emplearon biorreactores de flujo ascendente (BFAs) como un modelo de microcosmos para el cultivo continuo de bacterias nativas bajo condiciones del medio marino y se evaluaron atributos ecológicos como la variación de la riqueza y la distribución de las abundancias relativas de aislamientos bacterianos a través del tiempo; con estos resultados se contribuyó al conocimiento de la diversidad de poblaciones bacterianas hidrocarburoclásticas que proporciona información acerca de la respuesta de estas poblaciones frente a la perturbación con hidrocarburos, temas que en general se encuentran infravalorados y cuyo estudio es fundamental para el desarrollo de técnicas en biodegradación de hidrocarburos en los ecosistemas marinos de la costa pacífica Colombiana.