Maintenant, Simon, Jared et Mallory Grace sont sûrs que les fées existent et certains qu'ils n'auraient jamais dû voler le livre magique d'Arthur Spiderwick. Des gobelins invisibles à l'œil nu traquent les enfants pour reprendre le fameux guide. Coup de chance, Jared trouve une lunette de pierre aux pouvoirs extraordinaires. Grâce à elle, il repère enfin ses ennemis ! La lutte entre le monde magique et les enfants Grace peut enfin commencer...