Un nouveau chapitre s'ouvre dans l'univers de Kingdom Hearts ! Alors que Roxas et ses amis savourent un repos bien mérité et préparent le tournoi de Struggle, d'étranges phénomènes surviennent. Qui est ce garçon dont l'image hante les rêves de Roxas ? Quelles sont ces créatures qui semblent le poursuivre ? Et que sont devenus Sora, Donald et Dingo ?